Abby è torturata dagli incubi. Uno psicologo della marina è stato incaricato di sottoporre la squadra di Gibbs ad una valutazione psicologica post trauma per via dell’attentato alla sede dell’NCIS. Una addetta all’armeria, Margaret, scomparsa dall’evacuazione il giorno dell’attentato, viene ritrovata in fondo a un lago nella sua macchina, assassinata. Gibbs e la squadra lavorano al caso mentre un irascibile Vance cerca di riportare tutto ossessivamente com’era prima dell’esplosione Le ricerche conducono dopo una falsa pista all’armeria, ma non sarà esattamente lì che il caso troverà una definitiva soluzione. Ducky darà il suo contributo alle ricerche del caso finendo poi per arrabbiarsi con Palmer ed abbandonare la sala autopsie molto stizzito. Abby invece, sullo sfondo di questa storia, per trovare pace dagli incubi, viene convinta da Gibbs a ricontattare il fratello biologico: ciò la aiuterà a riappacificarsi con se stessa e con i suoi incubi.